简单使用

直接使用镜像

由于我已经知道 dockerhub 上有 Debian 官方镜像了，并且 latest 分支/tag 永远指向最新的 stable，所以我可以直接：

singularity pull debian:latest

就可以在本地得到一个 debian_latest.sif 文件了。为了显式指定文件名，通常会使用 singularity pull debian.simg debian:latest 得到一个名为 debian.simg 的镜像，Singularity/Apptainer 镜像文件一般拓展名写为 SIF 或这 simg 方便识别，当然这纯粹是命名习惯无需硬性遵守。

有了镜像，使用的时候最常见两种情况：

# 在镜像中运行 foobar 命令
singularity exec foobar.simg foobar

# 进入镜像内 shell 交互环境
singularity shell foobar.simg

这里最常见搭配几个参数：

  • -w 或者 --writable，启用可写；
  • -e 或者 --cleanenv，清空当前环境变量；
  • -f 或者 --fakeroot，以 UID 0 运行，相当于 root 登录/ chroot；
  • -B 或者 --bind，映射主机文件/路径到容器

比如 singularity shell -wef debian.simg 就可以顺利 chroot 到刚刚下载的镜像里安装软件了。

WARNING: --writable applies to temporary sandbox only, changes will not be written to the original image.
INFO:    Converting SIF file to temporary sandbox...