Postgres 跨版本数据库迁移

Debian 的 Postgres 早就升级到 13 了,但是由于我太懒就一直没有升级数据库,这次要往数据库放新数据了,就想趁这个机会刚好把数据都迁移到 13 吧。以前看过类似资料,postgres 本身提供了升级工具,所以我想找个靠铺点的教程一步步照着来应该问题不大。

复习下 Logistic 回归基础

这一篇算是复习了,日渐觉得对于 Logsitic 回归了解得有点飘。这一篇就是找几个比较基础的东西看一下然后把 Logistic 回归从前到后过一遍。涉及到模型构建、模型拟合优度(Goodness of fit)、区分度(Discrimination)和校准度(Calibration)评价。

编译安装 R 并启用 Intel MKL 支持

微软似乎放弃 Microsoft R Open 这个项目了,那么以前写的 Microsoft R Open 的安装和配置 也就成了过去式了。我一直是同时用两个版本 R 的,在 Windows 上这个实现起来很简单,因为 Windows 上多个版本 R 本来就是可以共存的。但是在 Linux,至少是 Debian 上,这个就没那么简单了。以前 MRO 和 vanilla R 共存也算很优雅地解决了这个问题。现在要想多个版本就只能自己编译一个 R 了。

用 split.screen() 进行图形组合

这个是上次学 layout() 组合图形时就说以后再学的东西。

split.screen() 是由 base R 的 graphics 包提供的。这个系列还包括 screen()erase.screen()close.screen() 这些命令配合使用。这些命令能够在一个图形设备上创建和控制多个图形区(screen,不知道翻译成什么比较合适)。和前面的 layout() 类似,split.screen() 命令与其他的分割方法(par(mfrow), par(mfcol)layout())也是不兼容的。

用 layout() 进行图形组合

这个内容是看完 MSG 之后的补课。 图形组合其实以往用过很多种了,base R 里的 par(mfrow = c(), mfcol = c()), ggplot2 里的 facet_grid() 和 facet_wrap() ,还有非常好用的 cowplot 的 plot_gri

学习怎么用 R 画多边形

polygon 作图基本语法 文档示例 首先隆重推荐一下一本新书:现代统计图形 。这是谢益辉老师多年前写的书,最近在统计之都论坛一些人的协助之下转移到 bookdown 平台,具

alluvial diagram 冲积图

Quick Start with alluvial 更多用法和自定义 隐藏 改变层次 ggplot2: ggalluvial 宽数据格式 长数据格式 geom_alluvium 最近看文献看到一种新的数据可视化图,Alluvia 图,中文应该是冲积图?不知道

ggplot2 学习 第三部分:The Master List (下)

翻译整理自:Top 50 ggplot2 Visualizations - The Master List,有删改。 最后一部分了,希望一次完成🙈️。拖这么久主要是后面有些图不是很常用,所以没什么动力去仔细看。

Postgres + MIMIC 从头到尾

之前其实也写过这个了,但是比较零散和简单。这次换硬盘,也不打算迁移数据库,直接重新建立一次。所以从前到后记录一下。 参考: Installing MIMIC-III in a local Postgres database Why psql can’t

R 启动文件配置文件的加载

这个话题其实在之前两篇博文其实都有涉及到过,这次只是看到一些不错的资源和文档,所以干脆总结一下写得全面一点。 参考: R 文档: Initialization at Start of an R Session startup: Friendly

Bioconductor 中的 ExpressionSet 数据类型

1. 介绍 2. 从头构建一个 ExpressionSet 数据 Assay data Phenotypic data Annotations and feature data Experiment description Assembling an ExpressionSet 3. ExpressionSet 的一些基本特性 查看 ExpressionSet 的各个元素 取子集 本文翻译自 An Introduction to Bioconductor’s ExpressionSet Class