编译安装 R 并启用 Intel MKL 支持

微软似乎放弃 Microsoft R Open 这个项目了,那么以前写的 Microsoft R Open 的安装和配置 也就成了过去式了。我一直是同时用两个版本 R 的,在 Windows 上这个实现起来很简单,因为 Windows 上多个版本 R 本来就是可以共存的。但是在 Linux,至少是 Debian 上,这个就没那么简单了。以前 MRO 和 vanilla R 共存也算很优雅地解决了这个问题。现在要想多个版本就只能自己编译一个 R 了。

用 layout() 进行图形组合

这个内容是看完 MSG 之后的补课。 图形组合其实以往用过很多种了,base R 里的 par(mfrow = c(), mfcol = c()), ggplot2 里的 facet_grid() 和 facet_wrap() ,还有非常好用的 cowplot 的 plot_gri

学习怎么用 R 画多边形

polygon 作图基本语法 文档示例 首先隆重推荐一下一本新书:现代统计图形 。这是谢益辉老师多年前写的书,最近在统计之都论坛一些人的协助之下转移到 bookdown 平台,具

alluvial diagram 冲积图

Quick Start with alluvial 更多用法和自定义 隐藏 改变层次 ggplot2: ggalluvial 宽数据格式 长数据格式 geom_alluvium 最近看文献看到一种新的数据可视化图,Alluvia 图,中文应该是冲积图?不知道

ggplot2 学习 第三部分:The Master List (下)

翻译整理自:Top 50 ggplot2 Visualizations - The Master List,有删改。 最后一部分了,希望一次完成🙈️。拖这么久主要是后面有些图不是很常用,所以没什么动力去仔细看。

Postgres + MIMIC 从头到尾

之前其实也写过这个了,但是比较零散和简单。这次换硬盘,也不打算迁移数据库,直接重新建立一次。所以从前到后记录一下。 参考: Installing MIMIC-III in a local Postgres database Why psql can’t

R 启动文件配置文件的加载

这个话题其实在之前两篇博文其实都有涉及到过,这次只是看到一些不错的资源和文档,所以干脆总结一下写得全面一点。 参考: R 文档: Initialization at Start of an R Session startup: Friendly

Bioconductor 中的 ExpressionSet 数据类型

1. 介绍 2. 从头构建一个 ExpressionSet 数据 Assay data Phenotypic data Annotations and feature data Experiment description Assembling an ExpressionSet 3. ExpressionSet 的一些基本特性 查看 ExpressionSet 的各个元素 取子集 本文翻译自 An Introduction to Bioconductor’s ExpressionSet Class

R 里的随机数种子 set.seed()

这一篇只写一点很简单的小东西,R 里用 set.seed() 设置随机数种子。 以前呢,只知道 set.seed(1234) 是设置随机数种子保证数据分析再现性的,但是其实具体用法没有了解过。现在

R 中因子型变量的有序与无序

有序和无序因子变量 例子 解读 模型评价和比较 结语 今天涉及到的这个就很有意思了。很早开始我就对这个问题有点疑惑,但是一直没有抽出时间(好吧,其实主

科学上网笔记:Shadowsocks 和 v2ray

搭梯简单记录,我知道网上教程一 Google 一大把。我写下来主要是这是我一直在用的流程,但是每一次都要一边操作一边到处查,所以干脆就写下来算了。以后就可

ggplot2 学习 第三部分:The Master List (上)

翻译整理自:Top 50 ggplot2 Visualizations - The Master List,有删改。 这是整个 ggplot2 系列的第三部分也是最后一部分。当然从标题知道这是上部,当然不是因为是最后一部分估计

ggplot2 学习 第二部分:外观自定义

ggplot2 学习 第二部分:外观自定义 翻译整理自:The Complete ggplot2 Tutorial - Part 2 | How To Customize ggplot2 (Full R code) 。 这一篇将会介绍如何自定义一个 ggplot 图的 6 个主要部分,是一份涵盖了大部分

ggplot2 学习 第一部分:介绍

今天 Bing 差点 被 GFW,纪念一下用必应壁纸做封面吧 翻译整理自:The Complete ggplot2 Tutorial - Part1 | Introduction To ggplot2 (Full R code) 。 r-statistics.co 在我的浏览器书签里应该躺了起码大半年了,特别是其